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【Scientific Data】“丽茶5号”染色体水平基因组组装完成,助力浙南早茶分子精准育种

发布日期:2026-10-19 16:12


近日,我院茶叶研究团队在Nature旗下期刊Scientific Data(新锐分区Top,IF5years = 9.3)发表论文“Chromosome-level genome assembly of a cultivated tea tree (Camellia sinensis) cultivar Licha 5”,发布了浙南优势早生茶树品种“丽茶5号”的高质量染色体水平基因组组装成果。该成果为浙南早生茶树种质资源的首个基因组,为区域特色茶树资源开发利用、精准育种和茶叶产业发展夯实了基础。


 

“丽茶5号”系统选育自“福鼎大白茶”ד景白2号”杂交后代,该品种萌芽特早,3月初即可达到一芽二叶,早生优势突出。且所制绿茶条索紧结,显毫,氨基酸和茶多酚含量高,鲜爽品质突出,是浙南地区极具大面积推广种植的茶树品种。研究团队通过PacBio HiFi长读长、Illumina短读长和Hi-C染色质构象捕获技术,组装出包含15条pseudo-chromosomes的染色体级高质量基因组。组装大小3.1Gb,scaffold N50达210.39 Mb,contig N50达149.87 Mb;BUSCO完整度98.45%,Compleasm完整度99.69%;共注释到54,995个蛋白编码基因,功能注释率95.84%;重复序列占69.11%,其中LTR反转录转座子占52.33%。


 

该基因组填补了浙南早生茶树种质资源的基因组空白,为挖掘早芽萌发、新梢生长和茶叶品质相关基因提供了重要框架,也为茶树遗传改良、分子育种及浙南早茶产业高质量发展提供了有力支撑。

我院何卫中研究员、中国计量大学尹传林博士为论文的共同通讯作者,我院陈利民副研究员和疏再发助理研究员为论文共同第一作者。周慧娟助理研究员、周大云高级农艺师、吉庆勇副研究员、冯亚颀助理研究员参与了这项研究。该研究得到了国家茶叶产业技术体系、浙南早茶优势特色产业集群项目、浙江省自然科学基金等项目的支持。


 

论文链接:https://doi.org/10.1038/s41597-026-08530-3


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文章来源: 茶叶研究所

作者: 陈利民

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