农林产品加工研究所负责农林产品贮藏与加工、副产物综合利用等产业发展研究，主要开展果蔬菌、林特产品、粮油、畜禽、水产品等的贮藏保鲜加工、功能评价与利用、特色食品资源开发利用等研发及成果推广工作，为丽水农产品加工行业市级科技创新平台组织单位，拟为我市农产品加工产业服务，提供技术支撑。现有科研人员5人，全部为高级职称或硕士研究生以上。

近年来，本所承担或参与省重大科技专项4项，其他各类科技项目20多项，组织项目获省科技进步三等奖1项，市科技进步二等奖2项，市科技进步三等奖1项，省市农业丰收奖多项（参与）。团队获授权国家发明专利10项，在国内期刊发表论文20多篇，出版专著1本，编写团体标准10项。