野生动物保护与特色养殖研究所成立于2019年，有动物科学、设施农业科学与智能化两个学科组。全所现有科研人员7人，其中副高职称4人，中级职称3人，硕士研究生2人，浙江省“新世纪151人才工程”第三层次培养人员1人，丽水市“138人才工程”第二层次培养人员1人。承担省重点科技专项2项，市科技项目7项。授权国家发明专利5项，发表论文10多篇，主编书籍7部，获国家科技进步二等奖1项，市科技进步一等奖1项。

动物科学组主要从事野生动物、珍稀濒危动物保护利用的研究，负责特色经济动物高效生态养殖及疾病防控技术的研发与集成创新，农副产品资源饲料化利用、蜜源植物挖掘。

设施农业与智能化科技创新团队主要从事设施农业和智能化农业的研究与技术推广工作，为农业现代化、智能化、设施化、生态高效化的可持续农业发展作开拓性的工作。